西历2015年。
魔术尚成立的最后的时代。
社会是由人之手构筑起来的，但掌握着世界真理的，却是魔术师。
魔术司掌着科学无法解释的人类过去的技术，科学则累积着魔术无法达成的人类未来的技术。
这两种决无法相容的学问之学徒，仅在某一点上是志同道合的。
无论是魔术还是科学，都是为了给钻研的人类带来更为长久的繁荣
——也就是，守护人类历史。
人理延续保障机构·迦勒底
观测仅靠魔术无法看见，仅靠科学无法测量的世界，预防会导致人类决定性灭绝事件的特务机构。
把优先让人类史延续下去作为至尊理念的这里不分魔法、科学，集结了各领域的研究者。
西历1950年，现象记录电脑使魔·拉普拉斯研究成功。
西历1990年，拟似地球环境模型·迦勒底亚斯完成。
西历1999年，近未来观测透镜·示巴完成。
西历2004年，守护英灵召唤系统·命运完成。
西历2015年，灵子演算装置·特里斯墨吉斯忒斯完成。
人理延续保障机构不断完成辉煌的成果，得以保证人类史将来100年内的安全。
然而2015年。
示巴所观测到的未来领域毫无前兆地消失。
根据计算，发现——不，是证明了人类将于2016年灭绝。
为什么。怎么会。是谁。做了什么。
面对众多疑问，迦勒底的研究者们陷入了疑惑。
就在这时，示巴观测到了新的异变。
西历2004年，在日本的某个地方都市。
在这里，出现了从未出现过的「无法观测的领域」。
迦勒底将这里假定为人类灭绝的原因，决定执行尚处于试验阶段的第六实验。
那就是回到过去的时间旅行。
将术者灵子化送往过去，通过介入事象，寻找出时空奇点，究明真相或予以破坏的禁断的仪式。
其名为圣杯探索——冠位指定（Grand Order）
这是一切为保卫人类，与人类历史对抗，与命运作战存在的总称。
在人理延续保障机构（迦勒底）的御主后补中，为了填补人员空缺而被找来的「新手」。
为了纠正混乱的人类历史，使用英灵召唤系统「命运」召唤从者，踏上了寻找7个圣杯（Grand Order）之旅。
在人理延续保障机构（迦勒底）与主人公邂逅的拥有不可思议氛围的心地善良少女。
称主人公为「前辈」。
与玛修一起遇到主人公的可爱动物。一直在迦勒底中自由自在地漫步。
出身于魔术名门阿尼姆斯菲亚，人理延续保障机构（迦勒底）的所长。观测未来，并想回避2016年人类的灭亡。
人理延续保障机构（迦勒底）的医生。负责管理御主候补们的健康情况。
造访人理延续保障机构（迦勒底）的主人公邂逅的性格直率的青年。
是制作了近未来观测透镜「示巴」的魔术师。本应为守护人理奉献自己的毕生，但是……。
为争夺被称为「圣杯」的「能实现任何愿望的奇迹」，7位御主与7名从者两两组成队伍，拼上自己的性命争斗到只剩下最后一组为止。
拥有让从者服从的资格，并参加圣杯战争的魔术师。本作主人公也会作为御主投身到围绕着圣杯的战斗中。
服从御主的从者。神话、传说中的英雄化身而成的使魔。为了让御主成为圣杯战争的胜利者，听从御主的命令，与其他御主（以及其从者）
战斗的争斗代行者。各自拥有被称为宝具的强大武器。
拥有让获得自己的人的愿望实现的力量。也被称为「万能之釜」或是「愿望机」。为获得圣杯而展开的争斗被称为圣杯战争。
御主手背上出现的印记，证明拥有参加圣杯战争资格的纹样。
圣杯为了将那些作为没有意志的纯粹「力量」被召唤、使役的英灵，作为假设物质进行具现化而准备的职责（容器）。
通常有「Saber」「Archer」「Lancer」「Rider」「Caster」「Berserker」「Assassin」这七种职阶。除此之外，有时还会用到其他职阶。
从者们各自拥有自己作为英灵的名字（真名），但历史上的各种事迹可能会暴露自己的弱点，因此通常会以职阶进行称呼。
